ケィオスの時系列解析メモランダム

時系列解析,生体情報学,数学・物理などの解説です.

心拍変動

【Rで時系列解析】Rでパワースペクトル推定:心拍変動解析での実際

Rで時系列のパワースペクトルを推定したいとき,もっともお気楽なのは,"spectrum"というコマンドを使うことだと思います.今回は,心拍変動 (RR間隔時系列)のスペクトル解析で"spectrum"コマンドを使った実例を紹介します.ちなみに,例として使用したRR間…

【心拍変動解析】心拍変動指標はどれを使えばいいの?

心拍変動を研究や商品開発で使いたいとき,まず,参照すべき論文があります.それが,以下のリンクにあります.https://www.ahajournals.org/doi/10.1161/01.CIR.93.5.1043 この論文のタイトルは, Heart Rate Variability Standards of Measurement, Physio…

【心拍変動解析】RR間隔時系列の再サンプリング (等間隔サンプリング化)

心拍変動解析では,パワースペクトルの推定を使った心拍変動指標がよく使われます.HFパワーとか,LFパワーとか呼ばれるやつです.今回は,これら指標について説明しません.心拍変動指標を計算する前に,絶対に理解しておかなければならないことがあるから…

【Rで時系列解析】心拍変動データを読み込み

今回は実際の時系列データを読み込んでグラフを描いでみます. 濃厚接触者として自宅待機中(現在)の私の心拍変動 (RRI間隔)時系列をサンプルとして使ってください.以下のリンクからダウンロードできます. https://drive.google.com/file/d/1i0VIooI1-IKA…

【時系列解析】1/fゆらぎ,1/fノイズ,何がおもしろいの?

今回は,何で「1/f(えふぶんのいち)ゆらぎ」とか,1/fノイズに注目するのか,何が不思議なのか,何がおもしろいのか,というお話です.1/fゆらぎについて,歴史と最新の成果を正確に記述することは,私には難しいので,まずは,現状の私の知識,印象,思い…

【心拍変動】NNって何,RRと違うの?

代表的な心拍変動指標(特に時間領域指標)の名前には,NNが入っていることが多いです.例えば,meanNN,SDNN,pNN50などです. meanNN すべてのNN間隔の平均値 SDNN すべてのNN間隔の標準偏差 pNN50 隣り合うNN間隔の差が50 msより長い拍の割合(%) 心臓…