これは研究や臨床検査用なので,一般には発売されていません.大学などの研究機関に所属していれば購入可能です.
といことで,今回はHJA-750Cを使って研究をしたい人向けのに,Rを使ったデータファイルの読み込み方の説明です.
活動量評価のデータファイルの中身
HJA-750Cの専用アプリで,計測結果 (集計ファイル作成)を書き出すと,
(被験者ID)10SECMETS_(計測日).csv
のような名前がついたファイルが作成されます.ファイル名の,(被験者ID)と(計測日)の部分は,それぞれ,各自が設定したID,計測日になります.今回はこのファイルを読み込んでみます.
計測結果のファイルの中身は,
(被験者ID) 2022/09/28 時刻,活動強度,運動種別 00:00:00,0,計測なし 00:00:10,0,計測なし 00:00:20,0,計測なし
のような感じです.この2行目が計測日です.4行目が各列の見出しで,5行目以下に計測結果が10秒ごとに記録されています.
HJA-750Cの計測データで注意してほしい点は,記録される時刻が必ず00:00:00からはじまることです.例えば,その日の夕方17:00:00に計測しても,データは00:00:00から記録されるので,00:00:00 ~ 17:00:00までの時間帯は,活動強度がずーっと「0」,運動種別がずーっと「計測なし」になります.
活動量ファイルの読み込み
Rでファイルを読み込みたいとき,私であれば以下のようにします.
# データがあるフォルダの指定 DIR <- "ここにデータファイルがあるフォルダを指定" # データファイルの指定 FN <- "10SECMETSファイルの名前を指定" #### # フォルダの移動 setwd(DIR) # ファイルから日付の読み込み YMD <- read.csv(FN,header=FALSE,skip=1,stringsAsFactors=FALSE,nrows=1)[1,"V1"] # ファイルからデータの読み込み DAT <- read.csv(FN,header=FALSE,skip=4,stringsAsFactors=FALSE) # DATの各列の変数名の設定 colnames(DAT) <- c("time","METs","activity_type") # timeを時刻データに変換 (日付+時刻) DAT$time <- as.POSIXct(paste(YMD,DAT$time),origin="1970-1-1 00:00:00") # グラフを描画 plot(DAT$time,DAT$METs,"l",col=2,xlab="Time",ylab="METs")
Windowsで"... invalid multibyte character ..."というエラーが出たら,上のスクリプトの11行目を
DAT <- read.csv(FN,header=FALSE,skip=4,stringsAsFactors=FALSE,fileEncoding="CP932")
に修正してください.
上のRスクリプトを実行すると,DAT
の中身は以下のようになります.
time | METs | activity_type |
2022-07-02 09:48:30 | 6.3 | 生活活動 |
2022-07-02 09:48:40 | 2.6 | 生活活動 |
2022-07-02 09:49:00 | 1.0 | 生活活動 |
2022-07-02 09:49:10 | 1.0 | 生活活動 |
2022-07-02 09:49:20 | 1.0 | 生活活動 |
2022-07-02 09:49:30 | 1.0 | 生活活動 |
さらに,「計測なし」の行を除きたいときは,以下のようにします.
# データがあるフォルダの指定 DIR <- "ここにデータファイルがあるフォルダを指定" # データファイルの指定 FN <- "10SECMETSファイルの名前を指定" #### # フォルダの移動 setwd(DIR) # ファイルから日付の読み込み YMD <- read.csv(FN,header=FALSE,skip=1,stringsAsFactors=FALSE,nrows=1)[1,"V1"] # ファイルからデータの読み込み DAT <- read.csv(FN,header=FALSE,skip=4,stringsAsFactors=FALSE) # 「計測なし」の行を削除 DAT <- DAT[DAT$V3!="計測なし",] # DATの各列の変数名の設定 colnames(DAT) <- c("time","METs","activity_type") # timeを時刻データに変換 (日付+時刻) DAT$time <- as.POSIXct(paste(YMD,DAT$time),origin="1970-1-1 00:00:00")
消費カロリーの計算
推定されたMETsを使って消費カロリーを求めたいときは,
エネルギー消費量 [kcal] = METs × (時間 [h]) × (体重 [kg])
を使います.インターネットで「METs 消費カロリー」検索すると,
エネルギー消費量 [kcal] = METs × (時間 [h]) × (体重 [kg]) × 1.05
という式が多く見つかると思います.最初の式と「× 1.05」の部分が違います.
どちらも間違いではなく,どちらも近似的な式で,どちらもほとんど値は同じです.「× 1.05」の部分は,体表面積などの影響で調整するための値を,標準的値で近似したものです.体型によって体表面積は異なるので,本当は個人個人で変えた方が良いかもしれません.とはいえ,年齢,性別など他の因子にも依存するので,しょせん近似です.
運動生理やスポーツ医学の業界では,「× 1.05」は省略してもいいでしょ,ということにしたようです.この論文で, [Ainsworth et al. Medicine & science in sports & exercise 43 (2011): 1575-1581],「× 1.05」なしの式が推奨されています.
ということで,METsデータから消費カロリーを計算してみましょう,と言うのが宿題です.